1．要根据消毒药物的性质和消毒对象，掌握好药物浓度和作用时间。
2．鸭舍在消毒前，要先彻底清扫。
3．要注意消毒药要求的酸碱度。
4．不同的病原体对不同的消毒药敏感性有很大差别。养殖户在消毒时尽量不要用两种消毒药物配合使用，并且两种不同性质的消毒药使用时要隔开时间。
5．喷雾消毒时最好选气温较高的中午，以防水分蒸发而使舍内温度降低，引起鸭受凉造成鸭群患病。另外，消毒前一天给鸭群饮用0.1%维生素C水或水溶性多种维生素溶液。
6．选择刺激性小、高效低毒的消毒剂，如0.02%百毒杀、0.2%抗毒威、0.1%新洁尔灭、0.3%-0.6%毒菌净、0.3%-0.5%过氧乙酸等。
7．在选择消毒药时，要多种轮换，交叉使用，防止病原微生物产生抗药性，每周更换一种消毒药，这样可以针对不同微生物发挥作用。
8．用生石灰消毒时，要把生石灰加水变成熟石灰，再用熟石灰加水配成乳浊液消毒。石灰水必须现配现用，不能停留时间过长，否则易使石灰水形成碳酸钙而降低消毒效果。在干燥的天气不用石灰粉在鸭舍内撒布消毒，避免漂浮在鸭舍内的石灰粉吸入鼻腔和气管，诱发呼吸道病。
9．消毒药的酸碱性一定要与所用水的酸碱性一致，否则不但效果差，甚至会无效。
10．鸭舍内的消毒不应只是简单的喷洒一遍，应重视天棚、门窗、供水系统及排污沟等卫生死角的消毒，防止这些地方变成了病原菌繁殖的场所。
