苹果树秋季的管理可分为树上和树下两方面的管理。树上管理主要是修剪、拉枝、除袋以及摘叶转果，树下管理主要是水肥管理。
1、修剪
8月中下旬，对强旺辅养枝枝头及大侧枝枝头全部进行戴帽处理，而对一些较弱的长放枝和中庸枝则选用戴死帽。另外，各级骨干枝和延长头一般不宜采用戴帽法修剪。
9月中旬左右，以清理内膛枝和当年生枝为重点，对内膛无效枝、重叠枝、交叉枝、徒长枝、竞争枝等进行疏除和回缩，修剪应适当，不可过重。
在果实采收前15～20天，对树上部的过密枝、拖地裙枝及外围丛生枝，进行带叶回缩或疏除，此时期修剪的剪口直径应不超过3厘米。
2、拉枝
8月中下旬至9月中下旬是苹果拉枝的最佳时间段，此时枝条柔软，可塑性大。对需永久保留的骨干枝，基角可拉成80度角左右，骨干枝每隔20厘米插空选留，螺旋排列；对于辅养枝，根据占有空间大小可拉成水平至下垂，基角掌握在90-120度；以缓和生长势，增加树体光照面积。
3、摘袋
苹果摘袋时间一般是采收前半个月左右，具体的时间要根据实际情况而定，冷凉或温差大的地区可适当晚摘；难上色的品种要适当早摘。
对于套了双层袋的果实，在果实熟前40天左右，先摘除外层袋，过一周左右再摘除内层袋。
4、摘叶、转果
脱袋后，要及时摘去贴果叶片和遮光叶片，使果实见光，促进上色。待果实的阳面着色后及时转果，使阴面转向阳面，这样果面着色才能均匀。
转果的人力成本和时间成本较高，对于面积大、结果密的果园，可通过铺设反光膜来增加内膛和下部果实的光照，以促进着色。
5、施肥
（1）磷钾肥：磷钾肥能够促进果实上色，苹果上色主要是花青素累积和叶绿素分解的结果，在苹果的生长过程中，随着果实的长大，叶绿素会逐渐分解，花青素会不断累积。在果实生长后期，磷酸二氢钾是不错的选择，采摘前一个月进行叶面喷施，喷2~3次，间隔一周。
（2）钙肥：钙是果实生长必不可少的元素，能显著提高果实的硬度，像苹果苦痘病、痘斑病都是由于缺钙引起的。
苹果进入膨大期后，果体不断膨大，果实内钙的浓度相应降低，果实会与枝条争钙，但是争不过旺长枝，如果钙的供应不足，就会导致果实中的钙倒流到枝条中，俗称“钙倒流”，因此八九月份要冲施一次液体钙肥，确保钙的供应充足。
采果前40天左右，是苹果树的一个需钙高峰期，此时期应喷施一次高浓度的液体螯合钙肥。套袋果摘袋后第2～3天，应再喷1次。
6、水分
这一时期灌水的关键技术是把握合理的灌水量，果实生长后期要严格控制灌水量，土壤水分不可过多，也不能让果园缺水。应时刻注意土壤墒情，控制灌水量，不可大水漫灌，以免造成裂果。如遇暴雨或连续阴雨，要及清沟排水，避免果园积水。
